Az Egyetemi Kórház igazgatási, szervezési, jogi, humánpolitikai feladatait az Főigazgatói Hivatal látja el. A Hivatal a főigazgató közvetlen irányítása alá tartozó szervezeti egység, melyet a hivatalvezető vezet. A Hivatal feladatai: az EIT hatáskörébe tartozó, Egyetemi Kórház feladatkörébe esőügyek előkészítése, a határozatok, döntések végrehajtása, az azokkal kapcsolatos igazgatási teendők ellátása, a főigazgató és a közvetlen irányítása alá tartozó vezetők munkájával kapcsolatos tikársági, iktatási és egyéb adminisztrációs feladatok ellátása,az Egyetemi Kórház iktatási rendszerének működtetése, Kórház szervezeti egységei számára koordinációs tevékenység végzése, a Kórház testületei működésével kapcsolatos koordinációs, előkészítő és ügyviteli feladatok ellátása, a bizottságok, testületek, tanácsok és egyéb szervezetek működtetése, a Kórház szakma specifikus testületei üléseinek szervezése, adminisztrációja, működésük felügyelete, hatósági ellenőrzések koordinációja a jelen Szabályzatban más szervezeti egység feladataként nevesített ellenőrzések kivételével.
Az Egyetemi Kórház külső levelezésének bonyolításában való közreműködés, a kórházi adatszolgáltatások intézményen belüli koordinálása, az adatszolgáltatások teljesítése a gazdasági tárgyú adatszolgáltatások kivételével, a gazdasági tárgyú adatszolgáltatások címzetthez történő megérkezésének és az adatszolgáltatás teljesülésének figyelemmel kísérése a Gazdálkodási Igazgatóság önálló adatszolgáltatási tevékenysége mellett. betegpanaszok kivizsgálásának koordinálása, válaszlevél tervezetek elkészítése, az Egyetemi Kórház feladatellátásához, tevékenységéhez kötődő civil szervezetek működésének felügyelete.
Ellátja az Egyetemi Kórház jogi és humánpolitikai tevékenységét, menedzsment tevékenységét, sajtó megjelenéseit, rendezvények lebonyolítását az Egyetem Rektori Hivatalával együttműködve.
Szervezi a főigazgató találkozóit, megbeszéléseit, gondoskodik az utazási feltételek biztosításáról, a személygépkocsi rendelések ügyintézéséről. együttműködik a Központ egyéb szervezeti egységeivel. Együttműködik a Rektori - Kancellári Kabinettel és a Kancelláriával.