A klinikán aktív alkalmazott és klinikai kutatás folyik természetesen a Raumatológiai Klinika és Reumatológiai Tanszék együttes közreműködésével. Orvosaink körében általános elvárás a PhD fokozat megszerzése. Jelenleg három MTA doktora, 4 med. habil. és 7 kandidátusi vagy PhD fokozatot szerzett kolléga dolgozik a klinikán/tanszéken. Kiemelt kutatási téma a rheumatoid arthritis (RA), a spondyloarthritisek (SpA) és a szisztémás sclerosis (SSc) patogenezise, az újabb diagnosztikus és terápiás lehetőségek. Ezen belül hangsúlyt helyezünk a gyulladásos-autoimmun kórképek társbetegségeinek (szekunder atherosclerosis, malignitások, osteoporosis) kutatására. Kutatómunka folyik a HLA és non-HLA gének, a genomika és a farmakogenomika területén is. Számos eredményt értünk el a modern képalkotó (PET-CT) és a labordiagnosztikai (citrullinált antigének elleni antitestek) módszerek alkalmazása, valamint a célzott (biológiai) terápia területén is. Három kutató munkacsoport alakult ki (RA, SpA, SSc), amelyek egymással is szorosan kollaborálnak. Új gyógyszerekkel, különösen biológiai készítményekkel eddig több mint 80 I-II-III-IV. fázisú klinikai vizsgálatot végeztünk.
A reumatológia a legtöbb orvosi szakmával határterületet képez. Ennek megfelelően számos egyetemi és egyetemen kívüli klinikával és laboratóriummal állunk tudományos-kollaborációs kapcsolatban. Egy közelmúltbeli felmérés alapján a tanszék rendelkezik a legmagasabb scientometriai mutatókkal a hazai reumatológiai centrumok közül. 2001 és 2021 novembere között 555 közlemény (ebből 294 angol nyelven), 15 könyv és 130 könyvrészlet jelent meg. Az elmúlt 20 év közleményeinek összes citációja (SCI) 10000 felett van. Számos nagy értékű GINOP, TÁMOP, NKFIH/OTKA, ETT, FKFP pályázatot, valamint több milliós gyógyszergyári ún. kutató által iniciált grantot, a DE ÁOK kutatási és oktatási pályázatait nyertük el. A kollégák 120-25 rangos külföldi és több hazai folyóiratnak állandó bírálói.